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軟件

產品名稱:ZEN Intellesis

產品簡介:可與蔡司其他軟件平臺一起使用的機器學習智能分析軟件

對于精銳的顯微圖像而言,其真正的價值在于從中提取的數據。圖像分割是當今顯微技術領域面臨的最大挑戰之一。分割為所有后續的圖像分析步驟奠定了基礎。ZEN Intellesis可以利用深度學習和Python輕松地呈現可靠且可重現的分割結果,即使是非專業人士也可以很容易地做到。您可以先訓練模型,然后ZEN Intellesis便能夠自動分割數百張圖像。這樣不僅節省時間,還能將用戶偏差降至最低。


利用深度學習進行圖像分割

要從精銳的圖像中獲取可靠數據,往往需要在多個圖像中分割多類對象。借助ZEN Intellesis,現在您可以利用專業知識在一些圖像上訓練軟件。數百張類似圖像的分割過程繁瑣耗時,現在這一工作可以由ZEN Intellesis強大的深度學習算法和Python基礎結構來完成。利用多通道特征提取方法,甚至可以分析復雜的多維和多模態數據,無論其來源如何。

簡便順暢的集成化工作流程

ZEN Intellesis軟件模塊讓深度學習簡便易用:您只需導入圖像、定義圖像類別、標記對象、訓練模型,再進行圖像分割。當達到您滿意的效果后,您就可以利用訓練好的模型來分割和分析完整的數據集。ZEN Intellesis可以完全集成到ZEN成像軟件的圖像分析向導中。集成到ZEN測量框架不僅可以確保所有重要的元數據保持連接,還可以用于后續的處理步驟。

分析多種來源、多種格式的多模態圖像

使用軟件模塊ZEN Intellesis,您可以輕松地分割來自不同來源的多維圖像,比如:

? 寬場顯微鏡
? 超高分辨率顯微鏡
? 熒光顯微鏡
? 無標記顯微成像系統
? 共聚焦顯微鏡
? 激光片層掃描顯微系統電子顯微鏡
? X射線顯微鏡

您可以分析處理ZEN成像軟件可讀的所有圖像格式,包括:CZI、TIFF、JPG、PNG、TXM和所有Bio-Formats兼容的圖像。


生命科學應用實例

1. 劃痕分析

Single frame of recorded time-lapse movie.
Segmentation result of ZEN Intellesis
單幀錄制的時間序列。
ZEN Intellesis的分割結果 - 劃痕區域(藍綠色),細胞層(橙色)和分裂細胞(紅色)。
scratch area measured over time
基于ZEN Intellesis的分割結果,采用ZEN圖像分析模塊隨時間測量劃痕區域的大小。

2. 樹突棘和樹突

spines on a dendrite
神經元的樹突表達綠色熒光蛋白。使用Elyra PS.1結構光照明獲得的圖像顯示了樹突上的樹突棘。
Segmentation with ZEN Intellesis results in a clear separation
使用ZEN Intellesis分割可以將樹突棘(綠色)從樹突(紅色)和背景(藍色)中清晰分離。

3. 果蠅

X-Ray micrograph of a Drosophila melanogaster.
黑腹果蠅的X-射線顯微圖。采用蔡司 520 Versa采集的1,400張整個果蠅的z-stack。
X-Ray micrograph of a Drosophila melanogaster.
采用ZEN Intellesis獲取的分割結果 - 外骨骼(紅色),內部結構(藍色和黃色),背景(綠色)。
X-Ray micrograph of a Drosophila melanogaster.
基于外骨骼類的3D模塊渲染。

應用實例材料分析

XRM Sandstone – Original
XRM砂巖 – 原始圖像
XRM 砂巖 – 標記
XRM 砂巖 – 標記
XRM 砂巖 – 訓練和分割
XRM 砂巖 – 訓練和分割
XRM 砂巖 – IP功能輸出
XRM 砂巖 – IP功能輸出



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